Epidémiologie moléculaire des souches de Staphylococcus aureus résistant à la Méthicilline et des Enterobactérales productrices de BLSE et de Carbapénèmases dans la ville province de Kinshasa

Equipe scientifique :
1) Jean-Marie Liesse Iyamba (Faculté des Sciences Pharmaceutiques, Microbiologie- Résistance aux antimicrobiens, Université de Kinshasa, RDC)

2) Olivier Denis (Faculté de Médecine/ULB, Microbiologie-CNR bacilles Gram négatif multirésistants, CHU-UCL NAMUR, Belgique)

3) José WAMBALE MULWAHALI (Faculté des Sciences Pharmaceutiques, Microbiologie – Biologie Moléculaire – Résistance aux antimicrobiens, Université de Kinshasa, RDC)

4) Pascal Takaisi Kikuni (Faculté des Sciences Pharmaceutiques, Microbiologie-Résistance aux antibactériens, Université de Kinshasa, RDC)

Résumé
Des taux élevés de mortalité ont été enregistrés ces dernières années au service de pédiatrie des CUK sans qu’une étude ait été réalisée. Des échantillons de sang des cas de bactériémies seront prélevés et analysés au Laboratoire de Microbiologie Cliniques des CUK, puis les isolats seront envoyés au Centre Universitaire de Référence (Laboratoire de Microbiologie Expérimentale et Pharmaceutique) pour des analyses approfondies.

En raison du nombre croissant des souches bactériennes résistantes à de nombreux antibiotiques isolées, il s’agira de mener une analyse phénotypique pour déterminer la prévalence de la résistance aux antibiotiques prescrits des souches isolées.

Ensuite, une analyse génétique sera effectuée. Elle consistera à étudier la structure des populations bactériennes et la transmission des bactéries dans le service, l’analyse des relations génétiques et phylogénétiques entre les souches isolées et les liens entre génotypes et certaines propriétés d’intérêt médical (résistance aux antibiotiques, facteurs de pathogénicité et la production d’un biofilm).

Les souches bactériennes isolées de ces échantillons (SARM, bacilles à Gram négatif : Klebsiella, Acinetobacter baumanii, Pseudomonas aeruginosa) seront soumises aux tests de sensibilité pour déterminer leur profil de résistance, ainsi qu’à la caractérisation phénotypique et moléculaire (par spa-typing, Multilocus sequence typing (MLST), Electrophorèse en champ pulsé (PFGE), l’analyse de la cassette chromosomique SCCmec (Staphylococcal Cassette Chromosome mec) par une PCR multiplex pour les SARM ou une PCR en temps réel pour la détection de carbapénémases (bla KPC , bla OXA-48 et leurs variants, bla GES , bla IMP et bla VIM ) chez les entérobactéries et les bacilles à Gram négatif non fermentants.

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